綜合所得稅因具備有量能課稅功能，故大多數人皆認為所得稅是屬於較為公平的租稅；然而在計算所得稅的過程當中，稅法總會存在一些為正確衡量個人納稅能力，或基於某些特殊目的，允許個人由其總所得中扣減的項目，顯然地，扣減規定存在的同時，便是對所得稅稅基的一種侵蝕，有鑒於近年來屢屢有提出增列或擴大扣減項目的看法，以達某些政策目的，而量能課稅目的受到衝擊，本文乃研究對我國綜所稅各扣減項目對各所得階層的影響，並依租稅理論檢視有否不當侵蝕稅基及不公平情形，進而對我國綜合所得稅申的免稅額與各種扣除額規定提出建議。

為研究上述的問題，本文乃利用民國87年財政部財稅資料中心綜合所得稅申報核定統計專冊中之資料做分析，分析我國各項扣減項目之存在對各所得階層的影響，首先依統計資料分析扣減項目之使用情形，探究那些項目由那些所得階層所使用，再依租稅理論與各項扣減項目使用結果相互驗證，檢討國內扣減規定運用結果是否公平，及是否合理必要。再以公平指標具體數量化，並模擬分析取消數項扣減規定後的結果。

研究結果發現我國扣減規定中，在所得十分位分析下，免稅額與各項扣除額使高所得階層課稅所得降低，較低所得階層降低的程度為大，除了標準扣除額外，由於我國採行累進稅制，扣除額制對高所得者較享優惠；在級距分析下發現，免稅額主要為低所得階層所使用，為低所得階層得以減輕稅負的最主要成因，特別扣除額與標準扣除額主要為中低所得階層使用，其中標準扣除額的存在與否對減輕稅負影響不大；列舉扣除額則主要為高所得階層所使用，為高所得階層得以減輕稅負的最主要成因。

依租稅理論檢視，國內的扣減規定的確有幾項在理論及實際使用結果上均有值得檢討的情形，通常多為違反租稅中立，為政策目的而設置的扣除額，例如列舉扣除額中的保險費、捐贈、政黨捐贈、自用住宅購屋貸款利息扣除額，特別扣除額中的儲蓄投資特別扣除額。以公平指標衡量結果，吉尼係數指標計算下，特別扣除額與兔稅額所造成的不公平程度較大；不公平程度較低者為標準與列舉扣除額；在Oshima指標計算下，高低所得間倍數差距最大的為列舉扣除額，次為特別扣除額，再為免稅額，倍數差距最低的為標準扣除額，主要因二種公平指標所衡量的點不相同，故結果有些許不同，吉尼係數主要重於衡量整體所得重分配，衡量結果會與扣減規定申報額占總所得比重有關，列舉扣除額不公平程度最低，特別扣除額與免稅額不公平程度較大的結果，與各扣減項目侵蝕總稅基實際結果相互應證；Oshima指標主要重於衡量最高與最低所得階層問的差距，與各所得階層在扣減規定的使用情形相關，因此衡量出列舉扣除額不公平程度較大的結果，與各所得階層實際使用情形結果相互應證。

綜合租稅理論、各所得階層實際使用情形，以及公平指標衡量之結果，本文將各扣除額進行模擬分析，結果在吉尼係數指標計算下，列舉扣除額中的保險費扣除額、特別扣除額中的儲蓄投資特別扣除額單一取消時，所得稅公平性會獲得改善，其中改善公平性程度最大的為儲蓄投資特別扣除額的刪減，捐贈扣除額及自用住宅購屋借款利息扣除額取消時，對改善公平較沒有助益，政黨捐贈扣除額取消，雖使所得稅的公平性會獲得改善，惟其影響不顯著；Oshmia指標模擬下，保險費扣除額、捐贈扣除額、儲蓄投資特別扣除額單一取消時，所得稅公平性會獲得改善，自用住宅購屋借款利息扣除額取消時，對改善公平較少助益。政黨捐贈扣除額取消，亦得出與吉尼係數指標計算下相同的結果。

本文建議國內免稅額與各項扣除額的改革應著重於對特定支出補貼的項目著手修正，這些項目又以列舉扣除額中所占部分最多，這些形同累退性質的租稅補貼，未來應予加以檢討，包括捐贈、保險費、儲蓄投資等較不公平的多項列舉扣除額及特別扣除額。